Annoncée en juin au Caire, lors d'une conférence de presse, l'identification d'Hatshepsout, la première femme pharaon, constitue un événement majeur dans le monde de l'égyptologie.

Ce documentaire suit pas à pas l'enquête menée par une équipe internationale d'archéologues et de médecins. Hatshepsout : l'un des personnages les plus fascinants de la XVIIIe dynastie égyptienne.

Grâce à son intelligence et à son courage, cette femme politique exceptionnelle au destin singulier va parvenir à accéder pleinement au pouvoir suprême, traditionnellement réservé aux hommes. Profitant de la minorité de son neveu, cette théologienne novatrice devient la première femme pharaon.

Elle restera sur le trône d'Egypte pendant vingt-deux ans, de 1503 à 1482 avant Jésus-Christ. Période de prospérité remarquable, son règne est marqué par des expéditions commerciales en Ethiopie et par le lancement de grands travaux. Son temple funéraire près de Thèbes est une réalisation exceptionnelle.

Après la mort d'Hatshepsout, son beau-fils Thoutmosis III, longtemps tenu à l'écart du pouvoir, fait disparaître toutes les traces de sa belle-mère. Elle demeure ainsi un personnage d'autant plus mystérieux que sa tombe a été retrouvée vide.

L'énigme de la reine Hatshepsout, décédée depuis quelque 3 500 ans a fasciné plus d'un spécialiste. Pour tenter d'identifier la dépouille de la souveraine, le directeur du Conseil supérieur des antiquités égyptiennes, Zahi Hawas, et une équipe de médecins légistes ont soumis plusieurs momies au scanner et à des tests ADN, et comparé les résultats avec ceux obtenus sur son père et son oncle et mari : les pharaons Thoutmosis I et Thoutmosis II.

Cette véritable enquête scientifico-policière a porté ses fruits puisqu'elle a permis d'élucider en grande partie le mystère qui entourait la disparition de la reine.